La gestion des programmes est aux mains des responsables géographiques et techniques. Ils assurent le suivi des programmes selon les aires géographiques, depuis leur initiation jusqu’à l’achèvement. Il est le principal interlocteur du chef de mission sur le terrain. C’est une relation quasi quotidienne, surtout dans les missions d’urgence. Une grande partie de leur travail est consacrée à la collecte d’informations et à leur analyse.
Le responsable technique assure ces mêmes fonctions, si ce n’est qu’il agit dans un domaine de compétences précis : médical, nutrition, logistique et recrutement.